|
|
Precise Image Registration Used for Correction of Geometrical Image Distortion
Zemčíková, Petra ; Odstrčilík, Jan (oponent) ; Mézl, Martin (vedoucí práce)
The main objective of the thesis is using image registration for a precise description of a deformation field for a following removal of a geometrical distortion. The geometrically distorted images were captured by a transmission electron microscope. The first part of the thesis is dedicated to the theory associated with the electron microscopy, the formation of the geometrical distortion, and the image registration with the main emphasis on the intensity based non-rigid methods. The next part describes a developed method for modelling the geometrical distortion and for the image registration. The method is then tested on both test and real data and compared to the existing methods for image registration (such as Elastix open-source software).
|
|
|
Kriteriální funkce pro registraci obrazů sítnice
Horáková, Pavla ; Kolář, Radim (oponent) ; Harabiš, Vratislav (vedoucí práce)
Tato bakalářská práce se zabývá porovnáním kriteriálních funkcí, které jsou využívány při registraci obrazů sítnice oka. Kriteriální funkce vyjadřují míru podobnosti obrazů, a tím značně ovlivňují správnou registraci. Cílem práce je nalezení kriteriální funkce, která je nejvhodnější k přesné registraci snímků. Samotná registrace obrazů je velice složitá, je potřeba zohlednit různé aspekty kriteriálních funkcí, jako je jejich jednoznačnost a rovněž tvar funkce pro různě zkreslené snímky.
|
|
|
Correction of image distortion of microscopic scene
Temelová, Kristýna ; Kolář, Radim (oponent) ; Odstrčilík, Jan (vedoucí práce)
This diploma thesis describes a method of using image registration to correct geometrical distortions of images of regular crystalline structures acquired by a transmission electron microscope (TEM). The aim of this work is to create an algorithm in Matlab that can correct these distortions through finding a spatial transformation deforming the distorted image in order to fit it to its model grid. The transformation is searched with help of the optimization methods optimizing the chosen criterion function.
|
|
|
Optimalizace pro registraci obrazů založená na genetických algoritmech
Horáková, Pavla ; Mézl, Martin (oponent) ; Harabiš, Vratislav (vedoucí práce)
Diplomová práce se zabývá globálními optimalizačními metodami a jejich využitím při registraci medicínských obrazů. Hlavní cíl spočívá ve vytvoření genetického algoritmu a testování jeho funkčnosti na syntetických datech. Kromě testovacích funkcí a obrazců byl algoritmus podroben i skutečným medicínským snímkům. K tomuto účelu se vytvořilo grafické uživatelské prostředí s volbou parametrů podle aktuální potřeby. Přidáním iterační gradientní metody se algoritmus stal hybridním genetickým algoritmem.
|
|
|
Afinní lícování nativních a postkontrastních CT snímků mozku
Chmelík, Jiří ; Mézl, Martin (oponent) ; Walek, Petr (vedoucí práce)
Tato práce se zabývá řešením problému registrace obrazů mozku pořízených rentgenovou výpočetní tomografií. Úvodem práce je seznámení s metodami geometrických transformací obrazů, zejména pak afinní transformací. Dále se text zabývá problematikou interpolačních metod, výpočtů podobnostních kriterií a následné optimalizace. Veškerá problematika je řešena speciálně pro trojrozměrná data. Druhá část práce je praktickou ukázkou programu v prostředí MatLab® pro registraci pořízených snímků pomocí afinní transformace, jehož součástí je také algoritmus pro odstranění schodového artefaktu, podložky pod hlavu a pacientského stolu. Jako optimalizační algoritmus je použita metoda kontrolovaného náhodného prohledávání (CRS). Vzhledem k typu medicínských obrazů poskytovaných ve formátu DICOM je součástí práce také proces jejich načtení a uložení.
|
|
|
Precise Image Registration Used for Correction of Geometrical Image Distortion
Zemčíková, Petra ; Odstrčilík, Jan (oponent) ; Mézl, Martin (vedoucí práce)
The main objective of the thesis is using image registration for a precise description of a deformation field for a following removal of a geometrical distortion. The geometrically distorted images were captured by a transmission electron microscope. The first part of the thesis is dedicated to the theory associated with the electron microscopy, the formation of the geometrical distortion, and the image registration with the main emphasis on the intensity based non-rigid methods. The next part describes a developed method for modelling the geometrical distortion and for the image registration. The method is then tested on both test and real data and compared to the existing methods for image registration (such as Elastix open-source software).
|
|
|
Correction of image distortion of microscopic scene
Temelová, Kristýna ; Kolář, Radim (oponent) ; Odstrčilík, Jan (vedoucí práce)
This diploma thesis describes a method of using image registration to correct geometrical distortions of images of regular crystalline structures acquired by a transmission electron microscope (TEM). The aim of this work is to create an algorithm in Matlab that can correct these distortions through finding a spatial transformation deforming the distorted image in order to fit it to its model grid. The transformation is searched with help of the optimization methods optimizing the chosen criterion function.
|
|
|
Advanced Algorithms for 3D Medical Image Data Fusion in Specific Medical Problems
Malínský, Miloš ; Flusser,, Jan (oponent) ; Kozubek,, Michal (oponent) ; Jan, Jiří (vedoucí práce)
Image fusion is one of today´s most common and still challenging tasks in medical imaging and it plays crucial role in all areas of medical care such as diagnosis, treatment and surgery. Three projects crucially dependent on image fusion are introduced in this thesis. The first project deals with the 3D CT subtraction angiography of lower limbs. It combines pre-contrast and contrast enhanced data to extract the blood vessel tree. The second project fuses the DTI and T1-weighted MRI brain data. The aim of this project is to combine the brain structural and functional information that purvey improved knowledge about intrinsic brain connectivity. The third project deals with the time series of CT spine data where the metastases occur. In this project the progression of metastases within the vertebrae is studied based on fusion of the successive elements of the image series. This thesis introduces new methodology of classifying metastatic tissue. All the projects mentioned in this thesis have been solved by the medical image analysis group led by Prof. Jiří Jan. This dissertation concerns primarily the registration part of the first project and the classification part of the third project. The second project is described completely. The other parts of the first and third project, including the specific preprocessing of the data, are introduced in detail in the dissertation thesis of my colleague Roman Peter, M.Sc.
|
|
|
Kriteriální funkce pro registraci obrazů sítnice
Horáková, Pavla ; Kolář, Radim (oponent) ; Harabiš, Vratislav (vedoucí práce)
Tato bakalářská práce se zabývá porovnáním kriteriálních funkcí, které jsou využívány při registraci obrazů sítnice oka. Kriteriální funkce vyjadřují míru podobnosti obrazů, a tím značně ovlivňují správnou registraci. Cílem práce je nalezení kriteriální funkce, která je nejvhodnější k přesné registraci snímků. Samotná registrace obrazů je velice složitá, je potřeba zohlednit různé aspekty kriteriálních funkcí, jako je jejich jednoznačnost a rovněž tvar funkce pro různě zkreslené snímky.
|
|
|
Segmentace 3D obrazových dat na základě deformovatelných modelů
Klásek, Pavel ; Peter, Roman (oponent) ; Jan, Jiří (vedoucí práce)
Tato práce řeší úlohu předzpracování a segmentace lidských obratlů ze 3D obrazových dat výpočetního tomografu. Práce popisuje teorii segmentace a lícování obrazu, kterou aplikuje v konkrétním postupu řešení automatické lokalizace průběhu spinálního kanálu a lokalizace středů těl jednotlivých obratlů. Práce popisuje vznik 3D deformovatelných modelů obratlů a seznamuje s vývojem a průběhem procesu segmentace obratlů na základě lícování těchto 3D modelů. Dílo předkládá hodnocení přesnosti a spolehlivosti výsledků lokalizace a segmentace.
|
host ::
RSS.